Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms