Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB1P08034 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB1P08034 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJB1P08034 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJB1P08034 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms