Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGAP02671 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGAP02671 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGAP02671 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms