Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGHV3-9P01782 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms