Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

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Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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