Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF5BO60841 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF5BO60841 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms