Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRAMEF2O60811 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms