Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBTB39O15060 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms