Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms