Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPBD1B2RD01 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms