Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYSRT1A8MQ03 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms