Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R4GN57 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R4GN57 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
R4GN57 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R4GN57 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
R4GN57 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
R4GN57 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
R4GN57 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R4GN57 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
R4GN57 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
R4GN57 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R4GN57 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
R4GN57 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
R4GN57 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
R4GN57 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R4GN57 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
R4GN57 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
R4GN57 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
R4GN57 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
R4GN57 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R4GN57 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R4GN57 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
R4GN57 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
R4GN57 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R4GN57 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R4GN57 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R4GN57 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R4GN57 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
R4GN57 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
R4GN57 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
R4GN57 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
R4GN57 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R4GN57 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
R4GN57 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R4GN57 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
R4GN57 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R4GN57 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
R4GN57 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
R4GN57 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
R4GN57 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
R4GN57 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
R4GN57 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
R4GN57 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R4GN57 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R4GN57 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R4GN57 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
R4GN57 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R4GN57 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R4GN57 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
R4GN57 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R4GN57 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
R4GN57 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R4GN57 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R4GN57 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R4GN57 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R4GN57 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R4GN57 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R4GN57 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R4GN57 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
R4GN57 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R4GN57 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R4GN57 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R4GN57 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R4GN57 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R4GN57 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R4GN57 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R4GN57 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R4GN57 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R4GN57 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R4GN57 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R4GN57 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms