Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U7

RNF215, RING finger protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF215Q9Y6U7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF215Q9Y6U7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF215Q9Y6U7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF215Q9Y6U7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF215Q9Y6U7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms