Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCINQ9Y6U3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCINQ9Y6U3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCINQ9Y6U3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCINQ9Y6U3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCINQ9Y6U3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCINQ9Y6U3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCINQ9Y6U3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCINQ9Y6U3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SCINQ9Y6U3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCINQ9Y6U3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCINQ9Y6U3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCINQ9Y6U3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCINQ9Y6U3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms