Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPTNQ9Y639 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPTNQ9Y639 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NPTNQ9Y639 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPTNQ9Y639 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPTNQ9Y639 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms