Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN10AQ9Y5Y9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN10AQ9Y5Y9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
SCN10AQ9Y5Y9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN10AQ9Y5Y9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN10AQ9Y5Y9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms