Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SF3B6Q9Y3B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms