Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNIP3Q9Y2W7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms