Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITM2BQ9Y287 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITM2BQ9Y287 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2BQ9Y287 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms