Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GNEQ9Y223 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GNEQ9Y223 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GNEQ9Y223 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GNEQ9Y223 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GNEQ9Y223 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GNEQ9Y223 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNEQ9Y223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms