Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVW-1Q9UQF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVW-1Q9UQF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVW-1Q9UQF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms