Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AGTPBP1Q9UPW5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AGTPBP1Q9UPW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms