Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP22Q9UPT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP22Q9UPT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP22Q9UPT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms