Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLBQ9ULI2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIMKLBQ9ULI2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIMKLBQ9ULI2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIMKLBQ9ULI2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIMKLBQ9ULI2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms