Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ZNF608Q9ULD9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ZNF608Q9ULD9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
ZNF608Q9ULD9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
ZNF608Q9ULD9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ZNF608Q9ULD9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ZNF608Q9ULD9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ZNF608Q9ULD9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
ZNF608Q9ULD9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms