Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLXNA1Q9UIW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNA1Q9UIW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA1Q9UIW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms