Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP13Q9UII6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP13Q9UII6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP13Q9UII6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP13Q9UII6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP13Q9UII6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP13Q9UII6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP13Q9UII6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms