Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO40Q9UH90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO40Q9UH90 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXO40Q9UH90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXO40Q9UH90 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms