Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTRF1LQ9UGC7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRF1LQ9UGC7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTRF1LQ9UGC7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms