Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLIP2Q9UDT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP2Q9UDT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLIP2Q9UDT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLIP2Q9UDT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP2Q9UDT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms