Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD3Q9UBI1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD3Q9UBI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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