Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC17A7Q9P2U7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC17A7Q9P2U7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC17A7Q9P2U7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC17A7Q9P2U7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms