Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARSQ9P2J5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARSQ9P2J5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LARSQ9P2J5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARSQ9P2J5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARSQ9P2J5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms