Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2NLQ9P2B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms