Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SENP1Q9P0U3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SENP1Q9P0U3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SENP1Q9P0U3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SENP1Q9P0U3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms