Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CABP1Q9NZU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CABP1Q9NZU7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CABP1Q9NZU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CABP1Q9NZU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CABP1Q9NZU7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CABP1Q9NZU7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms