Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
BICRAQ9NZM4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
BICRAQ9NZM4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
BICRAQ9NZM4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
BICRAQ9NZM4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC47.42■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC47.42■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC47.41■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC47.39■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
BICRAQ9NZM4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC47.37■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC47.35■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
BICRAQ9NZM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
BICRAQ9NZM4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
BICRAQ9NZM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC47.19■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC47.18■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC47.14■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
BICRAQ9NZM4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC47.1■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
BICRAQ9NZM4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms