Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBAP1Q9NZ09 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms