Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNK4Q9NYG8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNK4Q9NYG8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms