Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD3Q9NY59 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPD3Q9NY59 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD3Q9NY59 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPD3Q9NY59 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms