Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDND1Q9NY35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDND1Q9NY35 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLDND1Q9NY35 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDND1Q9NY35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDND1Q9NY35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms