Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF38Q9NXL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF38Q9NXL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF38Q9NXL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms