Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK13-1Q9NX77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK13-1Q9NX77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK13-1Q9NX77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms