Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OXSMQ9NWU1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OXSMQ9NWU1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OXSMQ9NWU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms