Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ASF1BQ9NVP2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASF1BQ9NVP2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASF1BQ9NVP2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASF1BQ9NVP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms