Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD4L1Q9NU39 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L1Q9NU39 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L1Q9NU39 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD4L1Q9NU39 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms