Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT82Q9NSB4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT82Q9NSB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT82Q9NSB4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT82Q9NSB4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms