Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A11Q9NSA0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC22A11Q9NSA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A11Q9NSA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A11Q9NSA0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms