Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LTBP3Q9NS15 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LTBP3Q9NS15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LTBP3Q9NS15 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LTBP3Q9NS15 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
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