Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLSCR3Q9NRY6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PLSCR3Q9NRY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PLSCR3Q9NRY6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLSCR3Q9NRY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms